推動兩性平等教育，最早起於1988年，婦女新知舉辦「全國民間教育會議」時，針對國小、國中教科書檢視其中的性別歧視。之後，1993年一批性別研究的女學者，成立女性學學會（女學會），集中火力批判大學軍護課程性別角色的刻板分工，進一步要求廢除軍護課程，並呼籲高中的家政與工藝課程，應該開放讓男、女學生自由選修。
1995年，女學會舉辦〈臺灣婦女處境研討會〉，其中，謝小芩教授發表〈教育：從父權的複製到女性的解放〉，首次針對國內教育中的性別問題，提出詳盡的分析與批判。同年，婦女新知主動向行政院教育改革審議委員會提案，從事「落實兩性平等教育」的研究。
1996年底，教改總諮議報告書出爐，其中涵蓋落實兩性平等教育。接著，由於彭婉如案的影響，政府快速通過「性侵害犯罪防治法」，其中第八條規定，中小學每學年必須實施至少四小時的相關教育，「兩性平等教育」包含其中。至此，兩性平等教育終於取得初步的法源基礎。緊接著1997年3月，教育部成立「兩性平等教育委員會」，督促各大學及縣市教育局推動校園兩性平等教育。
由於缺乏法源基礎，婦女團體擔心兩性平等教育，無法全面長久落實，一直呼籲教育部要研擬兩性平等教育法。2000年1月，兩性平等教育委員會委託沈美真，蘇芊玲、謝小芩、陳惠馨四位學者專家，經一年的努力，研擬出七章四十一條文的兩性平等教育法草案。這期間發生，恰巧爆發國中男學生葉永誌死亡事件，四位學者瞭解到，學校教育體制內，應對不同性取向的學生加以尊重，建議教育部將兩性平等教育法，更改為性別平等教育法。
2002年3月，教育部邀約十三位學者專家，成立了性別平等教育法草案研修小組，經過一年密集審慎的討論（4場公聽會、29次全組會議及10次分組會議），2003年5月完成七章三十八條，涵蓋學習環境與資源、課程／教材與教學、申請調查及救濟等項目的性別平等教育法草案。
2004年3月31日，性別平等教育法經行政院會通過之後，進入立法階段。為了迫使立法院能注重此法案，5月4日，臺灣性別平等教育協會、婦女新知基金會、臺北市女性權益促進會、臺灣婦女團體全國聯合會、臺灣女性學學會、臺灣同志諮詢熱線協會等團體聯合成立「性別平等教育法民間推動聯盟」，展開一連串遊說活動。
2004年6月4日，「性別平等教育法」在立法院三讀通過，6月23日由總統公佈實施。臺灣的性別平等教育，自此終於有了正式法源，得以展開全面落實且長遠的性別平等教育工作。
李元貞，〈臺灣婦運──百草千花的躍動〉，《國史館館刊》，期34（2003年6月），頁3－15。
蘇芊玲，〈臺灣推動兩性平等教育的回顧與前瞻〉，《兩性平等教育季刊》，期14（2001年2月），頁13－18
沈美真，〈兩性平等教育法草案立法精神與重要條文介紹（第一、五、六章）〉，《兩性平等教育季刊》，期14（2001年2月），頁34－37。
陳惠馨，〈教育部「兩性平等教育法草案」的立法過程與內容〉，《兩性平等教育季刊》，期14（2001年2月），頁25－33。
謝小芩，〈教育：從父權的複製到女性的解放〉，收入劉毓秀主編，《臺灣婦女處境白皮書：1995》（臺北：時報文化，1995），頁182－218。
台灣性別平等教育協會
