2004年6月施行的「性別平等教育法」,是從2000年開始,教育部委託相關學有專長的教授所訂立草案,而其中主持研究小組的學者,即是任教於政治大學法律系的陳惠馨教授。這也是她積極投入婦女運動的契機。陳惠馨曾擔任財團法人婦女權益促進發展基金會第四屆常務董事、總統府性別主流化諮詢顧問小組副執行長,同時,也是女學會第六屆的會長。
在她研究當中,不但有現行法律當中的性別議題,並且關注傳統唐代及清代法律中的性別問題,著有《傳統個人、家庭、婚姻與國家——中國法制史的研究與方法》一書。在教學中,她也指導學生了解性別與法律之間的關係,開設各種相關課程。